Naomi Hunter
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Ultime source de savoir mondiale en matière de thérapie génique, ancien médecin-chef de FOXHOUND. Entrepreneur civil envoyé par ATGC pour superviser les travaux de thérapie génique des membres de FOXHOUND et des Soldats génomes. Naomi est aussi experte en technologie de nanomachines et sera chargée de surveiller les données vitales de Solid Snake pendant l'incident de Shadow Moses de 2005. Le personnel la nomme affectueusement "Dr. Naomi". Parallèlement à la recherche génétique, elle se passionne également pour la culture des roses bleues.
Naomi est l'inventeur d'une technique baptisée ciblage génétique, qu'elle utilisera pour développer le virus assassin FOXDIE, à la demande de la DIA. Profitant d'une piqûre de peptides antigel faite à Solid Snake, elle lui injecte également FOXDIE. La CIA avait décidé d'utiliser Snake comme vecteur du virus FOXDIE. Cibles du virus: les deux otages sur Shadow Moses, nommément le responsable de la DARPA et le président d'ArmsTech, ainsi que les membres de FOXHOUND.
Elle prétendait que son père avait été rien. Naomi était en fait une orpheline rhodésienne récupérée par Gray Fox, alias Frank Hunter. Big Boss aidera Naomi et Gray Fox à émigrer aux États-Unis. Ils vivront ensemble comme frère et sœur, jusqu'à son entrée à l'université. Elle en voudra à Solid Snake pour la mort de Gray Fox et projettera secrètement de programmer FOXDIE pour cibler Snake. Mais son complot est éventé et Naomi est arrêtée en plein milieu de la mission sur Shadow Moses, condamnée pour trahison et incarcérée dans une prison fédérale. Après l'incident de Shadow moses, les événements révèleront qu'après tout, Solid Snake n'était pas une cible du virus FOXDIE.