Big Boss

Dans les années 1990, Big Boss réintègre l'armée américaine pour commander la nouvelle unité des Forces spéciales FOXHOUND.

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En 1995, la révolte d'Outer Heaven pousse FOXHOUND à lancer l'Opération Intrude N313. Elle perd le contact avec Gray Fox, premier agent envoyé à Outer Heaven. Big Boss y envoie Solid Snake, sa nouvelle recrue. Solid Snake a pour mission de récupérer Gray Fox et de détruire Metal Gear. Mais sa démarche révèle que Big Boss est le cerveau derrière la révolte d'Outer Heaven. Big Boss tente de se débarrasser lui-même de Solid Snake mais il échoue et essuie une défaite.

Big Mama (MGS4)
Black Ninja
Bombardement d'Outer Heaven
CQC
CQC amélioré
Clone
Drebin (MGS4)
EVA
FOXHOUND
Ghost
Gray Fox
Gène Terminator (MGS4)
Gènes soldat
Incident de Shadow Moses
Insurrection de Zanzibarland
Kyle Schneider
Le projet "Les Enfants Terribles"
Les Patriotes
Les fils de Big Boss
Liquid Ocelot (MGS4)
Liquid Snake
Logo de FOXHOUND
Mercenaire de légende
Naked Snake
Naomi Hunter
Nom de code "SNAKE"
Nouveau Outer Heaven
Ocelot
Paradise Lost Army (MGS4)
Pettrovich Madnar
Projet Snatcher
Raiden
Roy Campbell
Régime militaire
Révolte d'Outer Heaven
Sniper Wolf
Soldat parfait
Solid Snake
Solidus Snake
Triple Crosser
Zero