Big Boss

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Dans les années 1990, Big Boss réintègre l'armée américaine pour commander la nouvelle unité des Forces spéciales FOXHOUND.


En 1995, la révolte d'Outer Heaven pousse FOXHOUND à lancer l'Opération Intrude N313. Elle perd le contact avec Gray Fox, premier agent envoyé à Outer Heaven. Big Boss y envoie Solid Snake, sa nouvelle recrue. Solid Snake a pour mission de récupérer Gray Fox et de détruire Metal Gear. Mais sa démarche révèle que Big Boss est le cerveau derrière la révolte d'Outer Heaven. Big Boss tente de se débarrasser lui-même de Solid Snake mais il échoue et essuie une défaite.