Big Boss

Negli anni '90 Big Boss rientra nelle file dell'esercito USA come comandante della nuova unità FOXHOUND delle forze speciali.

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Nel 1995 la rivolta di Outer Heaven spinge la FOXHOUND a lanciare l'Operazione Intrude N313. Dopo aver perso contatto con Gray Fox, il primo agente inviato ad Outer Heaven, Big Boss manda in azione una nuova recluta, Solid Snake, ordinandogli di liberare Gray Fox e distruggere il Metal Gear. Queste azioni smascherano però Big Boss come la mente dietro Outer Heaven. Di conseguenza cerca di far fuori personalmente Solid Snake, ma non vi riesce e viene sconfitto.

Big Mama (MGS4)
Black Ninja
Bombardamento di Outer Heaven
CQC (Close Quarters Combat)
CQC potenziato
Clone
Disordini di Zanzibarland
Drebin (MGS4)
EVA
Esercito del Paradiso Perduto (MGS4)
FOXHOUND
Gene terminatore (MGS4)
Geni soldato
Ghost
Gray Fox
I Patriots
Incidente di Shadow Moses
Kyle Schneider
Liquid Ocelot (MGS4)
Liquid Snake
Logo FOXHOUND
Mercenario Leggendario
Naked Snake
Naomi Hunter
Nome in codice "SNAKE" (serpente)
Nuovo Outer Heaven
Ocelot
Pettrovich Madnar
Progetto Les Enfants Terribles
Progetto Snatcher
Raiden
Regime militare
Rivolta di Outer Heaven
Roy Campbell
Sniper Wolf
Soldato perfetto
Solid Snake
Solidus Snake
Sons of Big Boss
Triplo giochista
Zero